Мочеполовые органы женщины включают кожу промежности ( в области заднего прохода), влагалище, шейку матки, матку, мочеиспускательный канал, мочевой пузырь, мочеточники и почки.
Матка, мочевой пузырь, мочеточники и почки являются стерильными.
Другие отделы урогенитального тракта колонизированы микроорганизмами.
Почему проксимальный отдел уретры и внутренняя часть шейки матки, свободны от микроорганизмов, остается непонятным.
Микробиота влагалища и уретры является одновременно и простой и сложной. Простая – в том, что обычно только от 1 до 10 видов постоянно присутствуют, несмотря на ежедневное воздействие мочи, фекалий и вагинальной жидкости. Сложная – по количественному и видовому представительству (от бактерий и простейших до хламидий и вирусов). Она представлена не только конкретными микроорганизмами, но и целыми микробными сообществами, которые можно обнаружить и изучить с помощью методов метагеномики.
Нормальная микрофлора изменяется в течение жизни (препубертатный период, репродуктивные годы и постменапауза) даже на почасовой основе.
Способность комменсальных микроорганизмов и организма-хозяина предохранять регион от вторжения собственной микрофлоры и микрофлоры полового партнера является уникальной. При этом окружение слизистых пребывает в постоянных изменениях, которые обусловлены гормонами, диетой, мочеиспусканием, дефекацией, менструацией, гигиеническими процедурами и инфекциями. Указанные обстоятельства существенно влияют на качество жизни женщин.
Для получения более полной информации о урогенитальной микробиоте необходимо применить современные молекулярно-биологические методы. Использование таких методов позволяет проводить более точную идентификацию микроорганизмов, по сравнению с биохимическими характеристиками.
Несмотря на современный уровень науки и более чем 100 летний период исследований, наши представления о микробиоте человека попрежнему остаются рамочными. Системные проблемы ее изучения наглядно представлены на модели исследования микробиоты кишечника. Так, из 1200 известных обитателей кишечника человека только 12% выявляются одновременно с помощью молекулярных и культуральных методов. В то же время около 75% обитателей кишечника могут быть обнаружены исключительно по генетическому маркеру SSU рибосомальной РНК, так как это преимущественно некультивируемые микроорганизмы. Полученная таким путем информация свидетельствуют о том, что количество обитающих в ЖКТ видов могут исчисляться тысячами. Однако молекулярно-биологические методы изучения микробиоты не должны вытеснить культуральные методы. Подробные фенотипические и молекулярно-генетические характеристики представителей микрофлоры человека необходимы для успешного поиска пробиотиков.
На самом деле, бактериальные культуры равнозначны, если не более существенны, чем ранее. Так, с 2015 по 2023 гг. у человека было выделено и описано всего 19 новых бактериальных видов кишечного происхождения.
Немаловажен и другой аспект – исследуемый материал. Например, Bacteroides, Clostridium, E.coli, Lactobacillus и Enterococcus составляют около 47 % общего количества бактерий в фекалиях и только 16% на слизистой оболочке. Все это в полной мере можно экстраполировать и на алгоритм изучения микробиоты мочеполовых путей. Ряд факторов влияет на микробиоту влагалища. Это беременность, менструация, оральные контрацептивы, эстрогензамещающая терапия, иммуносупрессоры, хирургические манипуляции во влагалище и использование антибиотиков широкого спектра.
Целесообразно заметить, что с медико-биологических позиций лактобациллы доминирующий, но не эксклюзивный компонент в составе молочнокислых бактерий. Группу представляют микроорганизмы рода Lactobacillus, Lactococcus, Leuconostoc, Streptococcus и Enterococcus, которые характеризуются низким содержание Г+Ц пар в составе ДНК, Грам + окраской, устойчивостью к кислой среде, аэротолерантностью и неспособностью к спорообразованию.Они обладают строго ферментативным метаболизмом конечным продуктом, которого является молочная кислота. Таксономически эти бактерии близки и входят в состав
класса Bacilli, порядок Lactobacillales.
В целом видовой состав микробиоты женских мочеполовых органов включает:
- Lactobacillus spp.
- Staphylococcus spp.
- Corynebacterium spp.
- Enterococcus spp.
- Streptococcus SPP.
- Candida albicans.
- Bifidobacterium spp.
- Gardnerella vaginalis.
- Propionibacterium spp.
- Gram+ anaerobic cocci
- Bacteroides spp.
- Porphyromonas spp.
- Prevotella spp.
- Clostridium spp.
- Fusobacterium spp.
- Veillonella spp.
- Ureaplasma spp.
- Mycoplasma spp. и др